车船税和购置税在以下五个方面存在区别：

1. 定义：车船税是对在我国境内应依法到公安、交通、军事等部门进行相关登记的车辆和船舶，根据种类，按照规定的计税价格等进行征收的一种税费，属于地方税种，由当地有关部门征收。而购置税是对在我国境内行驶的汽车为课税对象，在特定的环节进行征收的一种税费，是国家规定必须缴纳的税费之一，由国家税务局征收。

2. 征税时间：车辆购置税是在购车时一次性缴纳，以后在车辆使用过程中无需在缴纳购置税。而车船税是每年都需要征收的，从2007年7月1日开始，需要在投保交强险时缴纳车船税。

3. 缴费标准：车辆购置税实行的是从价定率来计算应缴纳税额的。而车船税是按照固定税额征收的。

4. 计算方式：车辆购置税的计算方法是根据车辆销售价格一定比例来计算。而车船税的计算方法是按照车船种类、排量等来计算。

5. 税收目的：车船税主要是为了保障公路、水路等交通基础设施的建设和维护，同时鼓励节能减排和推广新能源车辆。而车辆购置税主要是为了调控市场，促进消费和鼓励技术更新。

总的来说，车船税和购置税虽然都是针对车辆的税收，但在具体规则和征缴方式，以及其背后的政策目的上存在显著的差异。